温暖关爱的特固蜥蜴成为遗传资源 天天动态

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发表在《今日开放存取期刊》上的GigaScience是一篇介绍tegu蜥蜴基因组的文章，tegu蜥蜴掌握了爬行动物世界中一项非常不寻常的技能：它可以打开自己的加热系统。

大多数爬行动物不能像哺乳动物一样控制自己的体温，而必须依靠所处的环境，如可利用的阳光和阴影，来获得最佳的体温。Tegu，Salvator merianae然而，它已经向完全温血迈出了一步：它可以将自己的体温提高到比周围环境高10C。tegu的另一个更负面的方面是入侵物种，这对濒危物种构成了严重威胁。虽然它是南美雨林和热带草原的土生土长，但它的魅力精髓——它甚至可以达到一定程度的家养训练，使它成为一种非常迷人的宠物，深受爬行动物爱好者的喜爱。不幸的是，外来宠物的国际贸易是物种进入新环境的主要原因之一，在新环境中，它们可能成为当地物种的威胁。鉴于tegu独特的生物特性及其对环境的潜在危险，

德国德累斯顿马克斯普朗克分子细胞生物学和遗传学研究所的迈克尔希勒领导的研究小组提供的tegu基因组序列具有前所未有的质量。为了实现这一目标，研究人员使用最先进的技术读取tegu的DNA，并组装其基因组序列。新发布的S. merianae基因组序列超过20亿个DNA字母，包含超过22，000个基因。这是迄今为止最完整的爬行动物基因组集合，也将有助于科学家研究其他蜥蜴和蛇。

通过使用所谓的“太平洋生物科学”测序技术，研究人员可以克服组装爬行动物基因组的一些挑战。Hiller和第一作者Juliana Roscito解释说：“像其他爬行动物一样，tegu基因组的很大一部分由重复序列组成，这些重复序列在基因组中出现多次。重复是基因组组装中的主要问题，特别是当重复序列比测序的DNA片段长度长时，这导致组装中的缺口(断裂)。”

Tegu本身就是一个有趣的模式物种。作者对tegu基因组测序的动机之一实际上与他们对另一组爬行动物的兴趣有关：蛇。作者解释了他们的想法：“我们对研究蛇和其他爬行动物的断肢感兴趣。由于无肢爬行动物的祖先有完全发育的四肢，我们需要一个组装良好的蜥蜴基因组，以完全发育的四肢作为参照。由于有测序基因组的爬行动物很少，作者决定自己制作。

文章的另一部分，特别考虑到爬行动物的代表性不足。作为一种基因组测序的脊椎动物，作者还提供了tegu和其他16种物种的全基因组比较。“我们希望这些资源可以促进比较爬行动物基因组学，以了解这一物种独特的形态特征是如何进化的，以及脊椎动物基因组是如何进化的，”迈克尔希勒和朱莉安娜罗斯西托总结道。

标签： 爬行动物 重复序列 脊椎动物 研究人员